该学校设有临床学院、基础学院、特教学院、口腔学院、护理学院、医学人文学院、中西医结合学院、药学院、卫生管理学院、成人教育学院等10个院。滨州校区设有的专业具体如下：
1、临床医学院设有临床医学，临床医学，医学影像学，麻醉学，医学检验，眼视光学；
2、护理学院设有护理学；
3、人文与社会科学学院设有法学、应用心理学；
4、中西医结合学院设有中医学、中药学。
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