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计税依据不同；计税依据是查账征收与核定征收最大的区别，查账征收是以所得税额为计税依据的，可以简单的为以利润为计税依据。核定征收是以收入*征定率得出的所得税额为计税依据。
申报表不同；查账征收的申报表是a类报表，核定征收的申报表是b类报表。
填写内容不同；查账征收需要填写，收入、成本、利润总额。核定征收只需要填收入即可。
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汇算清缴不同；查账征收的汇算清缴相当的麻烦，需要计算各种费用的标准，以及提出超额的费用。核定征收相对比较简单，只需算准收入即可。
财务管理不同；查账征收适用与财务管理健全的企业，核定征收是用于财务管理不健全，成本或者费用无法准确计算的企业。
选择企业不同；选择企业不同，主要是指企业是一般纳税人，还是小规模纳税人。简单的来说就是，通常查账征收适用于一般纳税人，核定征收适用于，成本或费用无法准确计算的小规模企业。
所得税率一样；虽然查账征收与核定征收有很多的区别，但是他们的所得税率是相同的。就是一般税率是25%，优惠税率可以简单的理解为10%。