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在微生物培养和食用菌生产中，常需进行消毒和灭菌，无菌等操作。它们都是为了消灭有害微生物，以便进行目的菌的纯培养。
灭菌级和无菌级本质上，并没有什么区别，灭菌就是需要达到无菌保障水平，即SAL=10^-6，而且灭菌需要杀灭包含细菌芽孢在内的所有微生物，最终达到无菌的目的，消毒是不需包含细菌芽孢在内的所有微生物，最终达到无菌的目的，消毒是不需要达到这个水平的。
另外菌的彻底程度受灭菌时间与灭菌剂强度的制约。微生物对灭菌剂的抵抗力取决于原始存在的群体密度、菌种或环境赋予菌种的抵抗力。灭菌后，达到无菌是获得纯培养的必要条件，也是食品工业和医药领域中必需的技术。
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