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农业工程类基本专业包括：农业工程、农业机械化及其自动化、农业电气化、农业建筑环境与能源工程和农业水利工程五个。
该专业主要目标是培养具有现代科学技术知识和工程实践能力的农业工程科学研究、设计规划、开发建设和管理、农业设施与环境、农业资源开发与利用、现代农业生产技术集成与管理、自动建设和管理、农业设施与环境、农业资源开发与利用、现代农业生产技术集成与管理、自动控制与检测等方面的高级复合型工程技术人才。本专业学生主要学习水利、土木工程学科的基本知识、基本理论，受到水利工程设计方法、科学研究方法及施工与管理的基本训练，具有水利工程的勘测、规划、设计、施工、管理等基本能力。
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