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ebi是为科学界建立和维护生物学数据库，提供免费的数据和生物信息服务。支持生物学数据的存储和挖掘，促进了科技进步，通过生物信息学的基础研究继续推动生物学发展。为各个层次的科学工作者提供生物信息学培训，支持帮助边缘尖端科技成果向工业界的转化并协调欧洲生物数据的提供。欧洲生物信息研究所拥有超过20年生物信息学研究和服务经验，是全球收集和传播生物数据、提供免费生物信息服务的欧洲节点。该所管理维护着世界最全面的分子生物数据库，其中很多是生物学家熟悉的数据库，例如ENA（核酸序列数据库），Ensembl（基因组），ArrayExpress（基因表达数据），UniProtKB蛋白质序列，InterPro（蛋白质家族/域/蛋白指纹等）和PDBe（大分子结构）。
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