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来源不同。鱼油与鱼肝油都是从鱼身上提炼出来不假，但鱼油主要是从深海鱼的脂肪层提炼而来的，而鱼肝油是从鱼肝里提炼出来的。
成分不同。鱼油是为了补充人体的不饱和脂肪酸而提炼出来的，含有EPA和DHA。而鱼肝油是从鱼肝里提炼的脂肪油主要是维生素A和维生素D。
功效不同。鱼油中的EPA可以降低人体血液中的胆固醇及甘油三酯，DHA对神经传导有作用，是大脑需要的重要物质。
而鱼肝油中的维生素A可以帮助维持视力，具有明目效果，还可以帮助组织生长发育。维生素D可促使肾小管对钙元素及磷元素的吸收，并使得钙元素往骨骼处转移，利于骨骼成长。
价格区别。鱼油有着脑黄金的称号，价格抑制昂贵。而鱼肝油与鱼油相比营养价值及功能单一，价格相对便宜。
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鱼肝油主要是婴幼儿滴食食用，补充维生素促进孩童生长。鱼油含有不饱和脂肪酸，虽说对于身体有很多好处，但不宜多吃。