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生物学家曾在35亿年前的历史悠久地质构造中发觉了相近蓝细菌的化石。蓝细菌比绝大多数病菌都大，可以代谢一层层薄薄细胞壁。最关键的是，蓝细菌可以产生大的糜棱岩构造，这类构造被称作叠层石。假如将这类叠层石磨好薄薄片，之中将会发觉储存细致的蓝细菌和藻类植物化石。
病菌既沒有硬实的人体骨骼，都没有硬实的机壳，若有病菌化石，他们是如何产生的呢？病菌那麼小，就是说产生化石了又怎么才能寻找他们呢？
实际上，病菌还确实能储存为化石呢。大自然里有个非常的性命类群，被称作蓝细菌，是宇宙上最开始的微生物之首。生物学家曾在35亿年前的历史悠久地质构造中发觉了相近蓝细菌的化石。蓝细菌比绝大多数病菌都大，可以代谢一层层薄薄细胞壁。最关键的是，蓝细菌可以产生大的糜棱岩构造，这类构造被称作叠层石。叠层石要以蓝细菌主导的微生物菌种在生长发育和基础代谢主题活动全过程中，附议接话沉定无机盐或捕捉矿物质颗粒物而产生的这种微生物堆积结构。假如将这类叠层石磨好薄薄片，之中将会发觉储存细致的蓝细菌和藻类植物化石。在我国河北张家口宣化至赤城第一线，18亿年前的早元古代末期的地质构造中带有很多的铁矿砂，他们组成了宣龙铜矿的行为主体。在宣龙铜矿的铁矿砂和伴生的叠层石铁矿砂中，就曾发觉了6个属的化石蓝细菌。
除开蓝细菌之外，化石病菌的总数不多。在特殊的有机化学标准下，病菌体细胞被无机盐替代后，产生自体的仿制品或是假晶。某些病菌可以代谢铁制的外鞘，有时候也可以产生化石。一些病菌能够钻进小动物的机壳或岩层中，在壳内或岩层中产生细微的管路，因而能够根据剖析不一样時期小动物机壳化石的这种管路简接了解他们。另一个，虎珀中一般能储存很多精致的病菌，一些病菌乃至历经一亿年以后还能生存。在某些小动物人体骨骼化石中也可发觉引起病症的病菌，表明这种小动物活著的那时候曾遭到过病菌产生的病苦。最让人惊讶的化石病菌将会是磁链球菌，这种病菌可以在体细胞内产生纳米技术尺寸的磁铁矿结晶。在20亿年前的历史悠久岩层中可辨别出该病菌造成的磁铁矿结晶，其尺寸为好多个mu;m，这将会是最少的化石了。
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