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1、手工去除法：如果在前期，绿藻较少，且依附在水草或玻璃壁上时。用牙刷轻轻将绿藻刷掉，如果较为顽固，建议剪掉一些水草，再进行缸内清水的更换即可，需要定期去做。
2、生物去藻：可以专门养一些吃绿藻的生物，在缸中，既可以进行绿藻的自我消化，这种方法较为简单，而且对水草的伤害最低。青苔鼠鱼，大河沼虾、黑壳虾、苹果螺等生物都可以消除绿藻，并且增加了水草缸的观赏性
3、药物去除法：现在有很多去除绿藻的药物，但对缸内生物有所伤害。所以一般不建议使用，如果绿藻实在过多，建议在使用前，降低药物的浓度，或者直接进行缸的更换。
4、定期换水：水草缸定期的换水，这样可以有效的减少缸内绿藻的成片生长。一般一周左右就要进行一次更换。一次换水量大概为1/3即可。这样不会对缸内生物造成伤害。
5、增加过滤系统，减少光照：对于水草缸，增加过滤系统减少缸内绿藻的滋生，从而保证缸内生物更好的生存。减少光照，光合作用，也会降低绿藻的生成，但是也还要保持每天一定时间的光照。
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