大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣,没有细胞核,但细胞中央含有核物质,通常呈颗粒状或网状,染色质和色素均匀的分布在细胞质中。 蓝藻细胞内的原生质体不分化成细胞质和细胞核,而分化成周质和中央质两部分。周质位于细胞壁的内面,中央质的四周,蓝藻的光合作用色素如叶绿素A,藻蓝素和藻红素等就存在于周质的光合片层中。蓝藻不具叶绿体、线粒体、高尔基体、中心体、内质网和液泡等细胞器,唯一的细胞器是核糖体。
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