东汉建安二十一年( 216 ),刘备分朐忍地置羊渠县,治城今长滩 , 为万州建县之始。蜀汉建兴八年( 230 ),省羊渠置南浦县,治城迁至今万州区南岸。
西魏废帝二年( 553 ),改南浦为鱼泉县,徙治江北(今万州区环城路)。北周时期( 557 - 584 ),先改鱼泉县为安乡县,后又改万川县,与南州和万川郡同治。
隋开皇十年( 598 ),废万州郡,改万川县为南浦县,与南州同治。炀帝大业三年( 607 ),省南州、南浦县归属巴东郡。
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唐武德二年( 619 )置南浦郡,领梁山、南浦、武宁 3 县;武德八年改南浦郡为浦州。贞观八年( 634 )改浦州为万州,天宝元年( 742 )改万州为南浦郡,乾元元年( 758 )恢复万州,仍与南浦县同治。
元世祖至元二十的年( 1283 ),省南浦县入万州,领武宁一县。
明洪武四年( 1317 ),并武宁县入万州,六年( 1373 )降万州为万县。
民国二十四年( 1935 )设万县专区。
1992 年 12 月国务院下文撤销万县地区建制设万县市(地级市),辖龙宝区、天城区、五桥区、开县、梁平县、忠县、云阳县、奉节县、巫山县、巫溪县、城口县 3 区 8 县。
2020年8月5日,创建万达开川渝统筹发展示范区统计联席会议在达州召开,达州市,重庆市万州区、开州区和云阳县四地统计局就统计工作协同发展进行了深度交流,协商建立跨行政区域统计合作机制,并签订了《创建“万达开”川渝统筹发展示范区统计战略合作协议》。