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按食用菌在自然环境中生活的主要营养来源可划分为木生菌、草生菌、粪生菌、土生菌等，其中包括了寄生菌和菌根菌。按它们作为主要营养的物料可归为木材、草料、粪便、土壤、农副产品、生物活体等类型。
1、木材：木材的纤维素、木质素等成分是木生型食用菌的良好养分。如香菇与壳斗科、金缕梅科等树种的亲和力最强，利用这些树种栽种可获得高产；
2、草料：草料含有食用菌生活必需的各种养分，来源充足，是草生型食用菌栽培的良好基质。多为禾本科植物的茎杆，如稻草、麦杆、玉米杆、干草等。适宜栽培草菇、蘑菇、平菇等食用菌；
3、粪便：反刍动物的粪便含有丰富的养分，而且经肠道微生物作用后有机氮含量比木材、草料要高，水分充足。最适合蘑菇、草菇等食用菌生活；
4、土壤含有丰富的有机质，不同的土质适合不同的食用菌生活。如砂质及花岗岩土适合香乳菇、绿菇生活；石灰质土壤适合粘绿乳菇、口蘑属的大多数种类生。
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