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食品微生物检测一般检查菌落总数、大肠菌群、霉菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌等项目。食品微生物检测是运用微生物学的理论与方法，检验食品中微生物的种类、数量、性质及其对人的健康的影响，以判别食品是否符合质量标准的检测方法。
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食品微生物检验方法是食品质量管理必不可准的检测方法。
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食品微生物检验方法是食品质量管理必不可少的重要组成部分，它是贯彻“预防为主”的方针，可以有效地防止或者减少食物人畜共患病的发生，保障人民的'身体健康。食品微生物检验是衡量食品卫生质量的重要指标之一，也是判定被检食品是否食用的科学依据之一。