除了陆龟与海龟以外,大部分的雄性爬行动物具有成对的管状性器官,称为半阴茎。陆龟与海龟则具有单一阴茎,所有的龟鳖目皆为卵生动物,而某些蜥蜴与蛇是卵胎生或胎生动物。爬行动物借由泄殖腔来交配繁衍,泄殖腔位于尾巴基部,可用来排泄与繁殖。爬行动物的蛋,外部是钙质蛋壳或皮革,覆盖者内部的羊膜,羊膜囊,以及尿囊。
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