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原因一：新生儿败血症发病原因之一是病菌的侵入。我国以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌最常见，克雷白杆菌，绿脓杆菌和L细菌感染常有报道，表皮葡萄球菌感染不断增加，GBS虽有报道但不多。
原因二：新生儿感染有可能在孕妇肚子里，也有可能在出生以后。宫内主要是通过胎盘传播感染，分娩过程中由产道细菌感染引起，生后感染最常见，细菌可侵入皮肤，黏膜。如消化道，呼吸道，泌尿道。
原因三：自身因素也是发病原因之一的，非特异性和特异性免疫功能均不完善，对病变局限能力差，细菌进入体内易使感染扩散而致败血症。男婴和低出身体重儿等相对容易获得感染，随出生体重的下降而发病率与病死率增高。
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