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发票种类不同小规模纳税人：开的是普通销售发票。一般纳税人：开的是增值税专用发票。
税率不同小规模纳税人：贸易型公司税率为4%，工业企业为6%。一般纳税人公司：税率为13%、17%。
缴税计算方式不同小规模纳税人：按开票额的4%计算应交税额。一般纳税人：需抵扣（进项抵销项）后再乘以税率而得出应交税额。
申请认定条件不一样一般纳税人：是需要另外申请的，要提供办公场地证明、购销合同等。小规模纳税人：不需要另外申请，公司注册好后默认为小规模纳税人。
对于销售额的要求不同小规模纳税人：贸易型企业年销售额在180万以下，工业企业年销售额在100万以下。一般纳税人：贸易型企业年销售额在180万以上，工业企业年销售额在100万以上。贸易型企业原为小规模纳税人，若年销售额超过180万，必须转成一般纳税人。
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企业所得税的征收方式不同小规模纳税人：企业所得税正式方式可以是查帐，也可以带征。一般纳税人：企业所得税必须是查帐征收。