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对于进入冬眠的动物来说，它们在身体方面，比如体温、呼吸以及心率等都会发生一定的改变，同时，新陈代谢会降到最低。对于热血动物和冷血动物来说，它们的的冬眠表现出了不同的特征。对于冷血动物来说，它们的体温会随着外部环境的变化而变化，可以说它们体温的变化是被动式的，而对于热血动物来说，它们的体温是自己调节的，它们会将自己的温度调到适合冬眠的时候，才开始它们的冬眠，当它们结束冬眠的时候，制造热量的器官就会被调动，将它们的温度调到原来的水平。
第二种是生物钟说。提出这一说法的科学家们认为，是生物的节律才导致了冬眠现象的产生，但是这一说法缺少事实性的根据。
第三种是认为动物的冬眠与动物体内的诱发冬眠的物质以及抗诱发物质的比例有关。科学家们对此作出这样的推断：冬眠的动物可能在一整年的时间里都会制造诱发冬眠的物质，正是由于这些物质，使得动物冬眠。而对于抗诱发物质来说，则是在动物冬眠之后才开始制造的。这种物质从制造开始起会不断的上升，到春天的时候，就会慢慢地下降。当动物的抗诱发物质的浓度高于诱发物质的浓度的时候，冬眠的动物就会醒过来。但是，对于这两种物质的性质以及由此带来的动物生理上的巨大变化，科学家们依旧没有搞清楚。
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