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上皮细胞的基底面常有基膜、质膜内褶和半桥粒三种特化结构。
基膜：是位于上皮基底面与其深面结缔组织之间的一层薄膜。电镜下可分为两层，由上而下分别为基板和网板。基膜由上皮和其下方的结缔组织共同产生，是两者进行物质交换的选择性透过膜，并有支持、连接作用，对上皮细胞的增殖、分化、迁移等也有重要作用。
质膜内褶：是细胞基底面的细胞膜向胞质内凹陷而形成的一些微小皱褶，皱褶之间的胞质中富含线粒体。其生物学意义是扩大了细胞基底部的表面积，有利于水和电解质的迅速转运。
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半桥粒：是上皮细胞基底面与其下方基膜间的半个桥粒样结构，可将上皮细胞牢固地连接在基膜上。