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紫菜泡水后变成紫红色是因为掉色，因为里面一种叫做“藻红素”的色素，这种色素是溶于水的，在发泡过程中掉色就是正常的现象。
藻红素是一种蛋白质类色素，受热就会发生变性，红色也就消失了。所以，平时煮紫菜汤的时候，煮熟后就没有红色了。失去藻红素的紫菜就变成绿色，这是因为紫菜中还有大量的叶是因为紫菜中还有大量的叶绿素。
紫菜在鲜活时本身就呈现深浅不同的紫红色，也是因为细胞中含有藻红素。由于藻红素降解速率快，除了特别新鲜的紫菜会是紫红色之外，一般的紫菜在经过加工、储存和运输之后只剩下了绿色的叶绿素，呈现绿色。所以，如果泡出来水是橘红色，恰恰还说明这个紫菜比较新鲜。
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