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第一：衣原体肺炎潜伏期2～3周，起病缓慢，约1/3病例无症状。以支管-支气管炎，肺炎，耳鼓膜炎等的形式出现，而以肺炎最重。发病初有乏力，头痛，咽痛，发冷，发热，肌肉酸痛，食欲减退，恶心，呕吐等，头痛显著。
第二：衣原体肺炎是由衣原体感染引起，没有特异临床表现，轻症可无明显症状，常有声音嘶哑、干咳、有时发热、咽痛等咽炎、支气管炎等症状，可持续数周之久，发生肺炎通常为轻型，与肺炎支原体感染的临床表现相似。
第三：衣原体肺炎是由肺炎衣原体引起的急性肺部炎症。临床表现无特异性。肺炎衣原体是上、下呼吸道感染的重要病原体之一，肺炎和支气管炎最常见，也可引起上呼吸道感染如咽炎、喉炎、鼻窦炎。
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