1、科属区别。穿山甲:为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、哺乳纲、真兽亚纲、鳞甲目、穿山甲科、穿山甲属地栖性哺乳动物;食蚁兽:食蚁兽为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、哺乳纲、披毛目、食蚁兽科哺乳动物。
2、形态区别。穿山甲:体形狭长,全身有鳞甲,四肢粗短,尾扁平而长,背面略隆起,头呈圆锥状,眼小,吻尖,舌长,无齿,耳不发达,足具5趾,并有强爪,前足爪长,全身鳞甲如瓦状,自额顶部至背、四肢外侧、尾背腹面都有,鳞甲从背脊中央向两侧排列,呈纵列状,鳞片呈黑褐色,绒毛极少;食蚁兽:食蚁兽吻部尖长,嘴管形,舌可伸缩,并富有粘液,适于舐食昆虫,耳小而圆,前肢力强,第三指具特别发达并呈镰刀状的钩爪,后肢4-5趾亦具爪。头骨细长而脆弱,无齿。
3、分布区别。穿山甲:生活在山麓地带的草丛中或较潮湿的丘陵杂灌丛,挖洞居住,多筑洞于泥土地带,主要分布于东南亚及非洲的部分国家;食蚁兽:侏食蚁兽树栖,大食蚁兽主要栖于潮湿的森林和沼泽地带,小食蚁兽日间多隐蔽在密林或躲在树洞里,夜间出来觅食,常用前肢爪捣毁蚁巢,主要分布于中美洲和南美洲从墨西哥最南端到巴西、巴拉圭的广大地区。
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4、食性区别。穿山甲:其主要食物为白蚁,此外也食蚁及其幼虫、蜜蜂、胡蜂和其它昆虫幼虫等,食量很大,一只成年穿山甲的胃,最多可以容纳500克白蚁;食蚁兽:食蚁兽吃蚂蚁、白蚁及其他昆虫,舌头能惊人地伸到60厘米长,并能以一分钟150次的频率伸缩,舌头上遍布小刺并有大量的粘液,蚂蚁被粘住后将无法逃脱,食量很大,一次可食454克重的蚂蚁。