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清华大学软件工程专业考研的主要科目有：马克思主义理论、大学外语、高等数学、大学物理、物理实验、线性代数、概率论与数理统计、程序设计语言、数据结构、离散数学、操作系统、编译技术、软件工程概论、统一建模语言、软件体系结构、软件需求、软件项目管理等。
考研需掌握的能力有：
1、具备扎实的数据基础理论和基础知识；
2、具有较强的思维能力、算法设计与分析能力；
3、系统掌握计算机科学与技术专业基本理论、基本知识和操作技能；
4、了解学科的知识结构、典型技术、核心概念和基本工作流程；
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5、有较强的计算机系统的认知、分析、设计、编程和应用能力；
6、掌握文献检索、资料查询的基本方法、能够独立获取相关的知识和信息，具有较强的创新意识；
7、熟练掌握一门外语，能够熟读该专业外文书刊。