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正文
免疫耐受。
通俗点讲，就是说身体接触乙肝病毒，没有像正常情况一样做出反应去抵抗病毒。乙肝疫苗，其实就是少量的乙肝病毒，注释入体内，就是希望能够通过这点少量的病毒引起机体的反应，去对抗病毒。而抗体就是对抗病毒的物质。免疫耐受的人就是碰了病毒也没有产生抵抗的物质，所以没有抗体产生。
剂量不足。
不同人，对于乙肝病毒的反应是不一样的，当然需要的乙肝病毒的量也是不同的。一般来说，在打了3针的乙肝疫苗之后，90%的人是会因为触碰了乙肝病毒而产生抗体。但也有人会因为的剂量不足，使得机体不足以产生抗体。这类人，身体的免疫功能是正常的，只是病毒的剂量需要比一般人高。
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免疫力低下或者服用免疫抑制剂。
有些人的身体免疫力低下（比如说艾滋病患者），或者是在注射乙肝疫苗期间服用过免疫抑制剂，在注射疫苗后，身体不能够根据病毒产生相应量的抗体，或者说产生的抗体含量很低，检测的仪器根本不能检查到，所以显示了抗体阴性。
隐形感染者。
也有可能是你在以前的时候已经感染上了乙肝病毒，但是由于身体免疫力较强，感染的乙肝病毒含量少，身体上没有产生明显的乙肝症状，检测仪器也因为体内的病毒含量过少，而没有监测到。所以虽然看起来是没有感染乙肝，但是是隐形的感染者。
没有乙肝病毒受体。
由于个人的先天因素，人体内没有乙肝病毒的受体，使得病毒没有给T细胞和B细胞信息。因为，身体也不会知道人体已经解除了乙肝病毒，已经感染了。所以，在这种情况下，体内的免疫系统也不能对乙肝病毒作出适当的应对措施，因为也就不会产生抗体，检测系统也就不能检测到。
认为是自身物质。
还有可能就是说，在注射乙肝疫苗后，人体不能有效识别乙肝病毒，身体的免疫系统认为乙肝疫苗是我们身体自身的物质，没有产生反应去清除它。所以，入侵到人体的乙肝病毒，就不能引起B细胞产生抗体，当然也就检测不到了。
检测方法不够精确。
检测乙肝疫苗的抗体有很多种方法，但是方法的类型不同，精确度是不一样的。可能这种方式检测不出来，换一种方式就能检测出来了，因为两者检测的最低值不一样。精确度高的方法，能够在很低的抗体浓度时，检测出抗体的存在。