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某些药物导致。临床患者采用抗生素(红霉素、庆大霉素、氯霉素、卡那霉素、氨苄青霉素等)进行治疗时，会导致碱性磷酸酶偏高，同时，而在临床上用巴比妥类这种药物治病时，也会出现碱性磷酸酶偏高的状况。
骨骼疾病。一般来讲，碱性磷酸酶在骨组织中的活跃性时很高，因此如果有骨骼疾病的患者会出现碱性磷酸酶偏高。如：佝偻病、软骨病、骨折愈合期、骨质疏松、骨恶性肿瘤、恶性肿瘤骨转移等骨骼疾病的患者一般会出现碱性磷酸酶偏高。
肝胆疾病。碱性磷酸酶在肝脏细胞中的数量最多，因此如果肝胆出现问题，碱性磷酸酶偏高是必然的。临床如：阻塞性黄疸、病毒性肝炎、肝癌(原发性、继发性)、肝硬化、胆汁淤积性肝炎等都可引起碱性磷酸酶偏高。
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