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鱼缸里的小虫以蛋白虫居多，蛋白虫属线虫的一种，体长1毫米至1厘米不等，白色，寄生于滤材缸壁或鱼体上，繁殖速度极快且很难清除。蛋白虫的危害极大。当虫体粘附于如罗汉鱼体一类鱼身上时会造成痒痛等不适，轻者造成罗汉蹭缸，重者造成罗汉突然撞缸、厌食、缩头、绺鳍等。尤其是粘附于罗汉鱼腮上时危害更大，所以产生了蛋白虫一定要及时清除。一般使用肠虫清类药物，该类药物通过阻止蛋白虫对葡萄糖等养份的吸收，使虫体耗光能量枯竭体能至死，对虫卵同样具体抑制和杀灭作用。适量食用对鱼基本没有损害。80-100cm缸一次两片，放在过滤出水口让水将药自然分解，使蛋白虫停食、断氧，约十分钟后即可显效，会看到鱼缸壁上有虫体脱落，下药24小时后基本可清除蛋白虫，换水三分之一或二分之一，次日再换水三分之一，以后逐渐适量换水稀试。可从根本上彻底清除蛋白虫，且不损害硝化菌。
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