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生态系统具有自我调节能力，这种调节能力是有限的，超过这个限度，生态系统仍会被破坏。生态系统是一个开放系统，具有自我调节功能。一般来说，成分多样、能量流动和物质循环途径复杂的生态系统自我调节能力强；反之，结构与成分单一的生态系统自我调节能力就相对更弱。
生态系统自我调节能力生态系统自我调节能力取决于生态系统营养结构的复杂程度。生态系统中生物种类越多，营养结构越复杂，自我调节能力就越强。故生态系统的自我调节能力取决于生态系统营养结构的复杂程度。
生态系统自我调节能力的基础是负反馈调节。它在生态系统中普遍存在的一种抑制性调节机制，例如，在草原生态系统中，食草动物瞪羚的数量增加，会引起其天敌猎豹数量的增加和草数量的下降，两者共同作用引起瞪羚种群数量下降，维持了生态系统中瞪羚数量的稳定。
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正反馈调节与负反馈调节相反，正反馈调节是一种促进性调节机制，它能打破生态系统的稳定性，通常作用小于负反馈调节，但在特定条件下，二者的主次关系也会发生转化，赤潮的爆发就是此类例子。