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1、日光消毒法：
将配置好的培养土放在清洁的水泥地或木板上薄薄地摊开，暴晒2到3天。如在夏季暴晒可以杀死大量病菌孢子、菌丝和害虫卵以及线虫。用此法消毒方法简单易行，但有时效果不明显。
2、加热消毒法：
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把已配好的培养土放入适当容器里，隔水蒸煮，30分钟即可消毒，也可将配置好的培养土放入铁锅里翻炒20到40分钟左右也能达到消毒的目的，但要注意加热时间不宜太长，否则会杀灭能够分解肥料的有益微生物，因而妨碍花卉的正常生育。
3、药剂消毒法：
常用福尔马林或高锰酸钾进行消毒，可在每立方米培养土中均匀撒上福尔马林400到500毫升50倍的稀释液，然后把土堆积，上盖塑料薄膜，密闭1到2天后取掉覆盖物并把土摊开，待福尔马林气体完全挥发后便可上盆使用。