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1、职称评定方式不同
认证工程师一般都要参加全国统一考试（即执业资格考试）后才能取得，指具有从事工程系统操作、设计、管理、评估能力的人员。工程师的称谓，通常只用于在工程学其中一个范畴持有专业性学位或相等工作经验的人士。这个在全国都有可以通用，只有行业性限制。
一般的工程师，也就是我们常说的职称，这个都是由省或部相关人事单位评定，评定时一般按你从业年限，工作业绩，获奖情况，发表论文著作等作为主要参考指标，多由单位评定后上报备案的，这个相对而言有地域性（或部门性）限制。
2、职称分类不同
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工程师是职业水平评定（职称评定）的一种。其下，有技术员，助理工程师等职称；其上有高级工程师，教授级高级工程师等职称，按职称（资格）高低，分为：研究员或教授级高级工程师（正高级）、高级工程师（副高级）、工程师（中级）、助理工程师（初级）。
而一般的工程师分类则没这么专业和复杂，是根据岗位多由单位评定后上报备案。