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1、过量水分
毛豆幼苗生长需要充足的水分，但不能抵抗水淹。如果土壤水分过多，毛豆幼苗的根将无法呼吸和生长，就会出现根不好的现象，因此，在下雨和下雨时及时将毛豆幼苗抽干，保持土壤稍微湿润是最合适的。
2、不当施肥
施肥不当也会导致毛豆幼苗的根腐病，如在土壤中施用原肥，在发酵成熟时施用肥料，产生的热量会烧掉毛豆幼苗的根，从而使毛豆幼苗腐烂，使毛豆幼苗施用腐朽肥料，需要掌握经常施用稀肥的原理。
3、疾病起因
种植毛豆时，如果土壤中细菌过多，可能会导致毛豆幼苗根腐病，从而导致根腐病，在这种情况下，需要及时使用药物控制毛豆幼苗，严重损坏毛豆幼苗，需要及时清除和销毁。
4、温度太低
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毛豆幼苗不耐冷，温度过低，会产生冻害，还会腐烂根部，因此毛豆幼苗的栽培需要在暖季进行，如果早春出现倒春冷现象，必须及时做好毛豆幼苗的保温措施，20-25℃的温度对毛豆幼苗的生长最有利。