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在数学建模中，主要软件分为统计类、规划类还有通用编程类。
1、统计类的主要软件包括R、SPSS、SAS。R和SAS可以根据自己的需求进行编辑，相对较为灵活。R不仅免费而且开源，有很多程序包都是相应专业人编写，已经在很大程度上满足了实际问题的需求。而SAS的优势在于权威。
2、规划类主要适用的是LINGO和LINDO，但两者相对适用较少，因为直接的规划类问题很少出现在建模竞赛之中。它们主要是解决规划类问题和运筹学的问题，包括线性规划，排队论等问题。
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3、通用编程类可以解决大多数问题。主要包括MATLAB和C等。MATLAB也有许多工具箱，同样可以解决类似的统计规划问题。MATLAB的优势就是运算单位为矩阵。C的优势就是它是最基本的语言，相对运行速度较快，比较适合编程基本功扎实的同学。