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商业用房办理房产证需要交纳：
（1）交易手续费：由售房人交纳，住宅：3元/平方米；
（2）登记费：由购房人交纳住宅：80元/套；
（3）物业管理公共资金：由购房人交纳，住宅：砖混结构15.6元/平方米，框架结构16.8元/平方米；
（4）房屋所有权证书工本费：一本免费，每增加一本收10元。
（5）印花税：印花税：分为“产权转移书据”印花税和“权利、许可证照”印花税。“产权转移书据”税目税率为万分之五，计税依据为书据中所载的金额，买卖双方均要交纳；“权利、许可证照”税目适用5元/件的定额税率，买方交纳。
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（6）契税：由购房人交纳，住宅：个人购买首套普通住房按交易额的1.5%交纳，非普通住房、个人购买二套以上、单位购买按交易额的3%交纳。
一般来说，商业用房办理房产税是高于普通用房的。