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消毒灭菌的物理方法有热力、电离辐射、超声波、过滤等。
热力灭菌；分干热灭菌法和湿热灭菌法两大类，干热灭菌法有焚烧、烧灼、干烤、红外线灯。湿热消毒灭菌法有：巴氏消毒法、煮沸法、流通蒸汽法、间歇灭菌法、高压蒸汽灭菌法。
化学消毒灭菌法：根据化学结构与性质不同分类 可以消毒剂分成酶类、醇类、重金属盐类、氧化剂、表面活性剂、烷化剂、染料、酸碱类等。
常用的化学消毒剂：卤素化合物是有效的杀菌和灭菌剂，用于水、食品、设施消毒。
碘伏常用作于皮肤的除菌。
酚类化合物是强效杀菌剂，通常用于物品消毒，温和类酚复合剂也可用于皮肤和粘膜的除菌。
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醇类溶解细胞膜脂质和破坏细胞蛋白，一般起抑菌作用。
过氧化氢起杀菌效能，用于伤口防腐和器具消毒。高浓度的过氧化氢有杀灭芽胞性能。