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普通PCR需要正反向引物各一条，即一对引物，有些特殊PCR需要多条引物。
pcr技术的基本原理类似于dna的自然复制过程，其特异性依赖于靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
pcr是一种体外dna扩增技术，它依赖于dna聚合酶在模板dna、引物和四种脱氧核苷酸存在下的酶促反应。待扩增的DNA片段及其两侧互补的寡核苷酸链引物通过“高温变性-低温退火-引物延伸”三步反复循环，使DNA片段的数量成倍增加，因此在短时间内，我们需要大量的特异性基因片段。
在环境检测中，靶核酸序列经常存在于细胞提取物等复杂混合物中，且含量非常低。对于检测这种复杂群体中的特定微生物或基因，杂交是不敏感的。
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pcr技术可以将目标序列扩增几个数量级，然后用探针杂交检测扩增序列，用于微生物种群结构的定性或定量分析。pcr技术常与rt-pcr、竞争pcr、巢式pcr、rapd、ardra等技术结合使用。