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1、对包衣种子处理不当，造成出芽不齐
种子包衣剂一般由化学剂和染色剂配比而成。因此，包衣的种子，浸种时如果处理不当，就会出现不发芽或发芽不齐的问题。对这类种子，浸种前用35℃的温水浸泡15分钟左右，而后用手轻轻地将种子上的种衣剂洗净，再进行浸种、催芽。
2、温汤浸种具有一定的作用
甜瓜温汤浸种的适温度为50-55℃，温度过高会种子。甜瓜温汤浸种应注意以下两点：一是严格掌握浸种的用水量，一般用水量是种子量的5-6倍；二是浸种过程要不断搅动，待水温下降到25-30℃时保持恒温浸种4-6小时，然后取出种子，搓去种皮上粘液，用清水冲洗2-3遍后再用湿布包好，在28-30℃条件下催芽。
3、切忌包裹种子用的布太湿
有些农民因怕种子发芽后的胚根扎入布中伤根，往往用平纹布包裹种子，有人又恐怕发芽的水分不够充足，就将布浸得湿湿的，再包裹种子，这些做法容易使种子由于缺氧而发生窒息。建议找一块干净毛巾，用开水烫过后，用劲将其拧干，而后将浸泡好的种子平摊好，包裹在里面。这样，既保温，通透性也好，有利于种子发芽。
4、催芽温度要适宜
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甜瓜催芽时间一般为24-30小时，催芽适温为28℃-32℃切忌温度过高。若用电热毯加热催芽，要随时观察温度，并翻动种子。以免温度过高导致种子蒸熟而不发芽和种子受热不均而发芽不齐。